Спасибо всем кто откликнулся. Производитель дисковой полки(аля хранилища) откликнулся - саппорт выдал странные числа для работы с Jumbo Frame - 7418/4074/1500 с которыми будет корректно работать. Выставил 7418 - работает уже 2 недели недели без сбоев.
Может быть наложилось - на ESXi стоят карты от Broadcom, утверждается на KB от vmware.com что есть проблемы у некоторых релизов этих карт и драйверов при работе с Jumbo Frame.