Мониторить можно закладкой Performance с фильтром по write/read requests и latency или сторонними утилитами, которые умеют читать эти параметры из базы. Потом смотреть внутри ВМ, что она делала во время скачка latency.
Нечастые скачки до 50 мс не смертельны, это может быть бекап или ещё какая операция обслуживания.