Настоятельно текомендую смотреть не на Adaptec, а на LSI. И работают они хорошо, и проблем с совместимостью на порядок меньше.
До кучи адаптеки реально тупой менеджмент имеют. LSI многое умеет делать на лету, без перезагрузок.
Контроллер берите любой, что удовлетворит потребности производительности. Старшие модели, c 1 гигом памяти, тащат легко 48 дисков и более.
Если хочется побюджетнее, то вот хороший вариант: http://www.lsi.com/products/raid-controllers/Pages/megaraid-sas-9261-8i.aspx
Только про батарейку к нему не забываем.