В общем метод, описанный в гайде по оптимизации работает не для всех параметров, например "обеспечить наилучшее быстродействие" (VisualFXSetting) не работает вот почему The Visual Effects dialog box just tells you what you want to hear - The Old New Thing - Site Home - MSDN Blogs. Решено следующим образом: удалил всех пользователей кроме администратора по умолчанию, сделал необходимые настройки, создал файл ответов такого вида (copyprofile скопирует профиль администратора в default):
<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<unattend xmlns="urn:schemas-microsoft-com:unattend">
<settings pass="specialize">
<component name="Microsoft-Windows-Shell-Setup" processorArchitecture="x86" publicKeyToken="31bf3856ad364e35" language="neutral" versionScope="nonSxS" xmlns:wcm="http://schemas.microsoft.com/WMIConfig/2002/State" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance">
<CopyProfile>true</CopyProfile>
</component>
</settings>
</unattend>
Далее выполнил sysprep:
sysprep.exe /oobe /generalize /reboot /unattend:c:\answerfile\unattend.xml
После этого ко всем новосозданным пользователям применяются необходимые настройки.