План действий таков:
1. Установить View Composer (можно на сам vCenter Server)
2. Снять защиту с объекта, который нельзя удалить, утилитой SviConfig
sviconfig -operation=UnprotectEntity -DsnName=<name of the DSN> -DbUsername=<Composer DSN User Name> -DbPassword=<Composer DSN Password> -VcUrl=https://<vCenter Server address>/sdk -VcUsername=<Domain\User of vCenter Server account name> -VcPassword=<vCenter Server account password> -InventoryPath=/<Datacenter name>/vm/VMwareViewComposerReplicaFolder/<Replica Name> -Recursive=true
3. Удалить объект обычным способом командой "Remove from Inventory" из контекстного меню
Подробно KB: 1008704